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デオキシリボアデノシン１リン酸（dAMP）の生成

chemfig/核酸(Oura)/核酸1.tex化学・構造式 chemfighybrid

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デオキシリボアデノシン１リン酸（dAMP）の生成 preview
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入力コード
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\pagestyle{empty}
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\begin{document}
\section*{デオキシリボアデノシン１リン酸（dAMP）の生成}

dAMP：deoxylibo Adenosine Mono Phosphate。DNAを形作るモノマーの１つ。

RNAで対応するモノマーはAMP。

\underline{dAMPとAMPを合わせてアデニンヌクレオチド}と呼ぶ。

\ 

\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
OH)(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}
\chemfig{H-[:60,1.2]*5(N?-*6(-N=-N=(-[2]NH_2)-=)--N=?)
}

\vskip0.5zw

\qquad リン酸 \qquad ＋\qquad\quad デオキシリボース\qquad ＋\qquad 塩基（例としてアデニン）

\quad\  分子量98\qquad\qquad\qquad\quad 分子量134 \qquad\qquad\quad\qquad\qquad 分子量135

\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 

\quad\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1C?[a](-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*5(N?[b]-*6(-N=-N=(-[2]NH_2)-=)--N=?[b]))(-[:-60]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8] % 1-2結合
^2C(-[2,,2] H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\quad\qquad リン酸 \qquad\quad ＋\qquad\qquad アデニンヌクレオ\underline{\textbf{シ}}ド

\qquad\  分子量98\qquad\qquad\qquad 分子量$134+135-18=251$


\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 


\qquad\chemfig{
^1C?[a](-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*5(N?[b]-*6(-N=-N=(-[2]NH_2)-=)--N=?[b]))(-[:-60]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8] % 1-2結合
^2C(-[2,,2] H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]O-[4]P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\qquad\qquad\qquad\qquad\qquad アデニンヌクレオ\underline{\textbf{チ}}ド

\quad\qquad\qquad\qquad\qquad  分子量$98+251-18=331$

\newpage

\section*{デオキシリボチミジン１リン酸（dTMP）の生成}

dTMP：deoxylibo Thymidine Mono Phosphate。DNAを形作るモノマーの１つ。

RNAで対応するモノマーは\underline{\textgt{U}}MPであり，こちらはチミン(T)を用いない。

そのため，\underline{dTMPだけがチミンヌクレオチド}と呼ばれる。

\ 

\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
OH)(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}
\chemfig{*6(N?(-H)-(=O)-NH-[,,1](=O)-(-CH_3)=?)}

\vskip0.5zw

\qquad リン酸 \qquad ＋\qquad\quad デオキシリボース\qquad ＋\qquad 塩基（例としてチミン）

\quad\  分子量98\qquad\qquad\qquad\quad 分子量134 \qquad\qquad\quad\qquad\qquad 分子量126

\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 

\quad\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*6(N?[b]-(=O)-NH-[,,1](=O)-(-CH_3)=?[b]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\quad\qquad リン酸 \qquad\quad ＋\qquad\qquad チミンヌクレオ\underline{\textbf{シ}}ド

\qquad\  分子量98\qquad\qquad\qquad 分子量$134+126-18=242$


\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 


\qquad\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*6(N?[b]-(=O)-NH-[,,1](=O)-(-CH_3)=?[b]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]O-[4]P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\qquad\qquad\qquad\qquad\qquad チミンヌクレオ\underline{\textbf{チ}}ド

\quad\qquad\qquad\qquad\qquad  分子量$98+242-18=322$


\newpage

\section*{デオキシリボシチジン１リン酸（dCMP）の生成}

dCMP：deoxylibo Cytidine Mono Phosphate。DNAを形作るモノマーの１つ。

RNAで対応するモノマーはCMP。

\underline{dCMPとCMPを合わせてシトシンヌクレオチド}と呼ぶ。

\ 

\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
OH)(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}
\chemfig{*6(N?(-H)-(=O)-N=(-NH_2)-=?)}

\vskip0.5zw

\qquad リン酸 \qquad ＋\qquad\quad デオキシリボース\qquad ＋\qquad 塩基（例としてシトシン）

\quad\  分子量98\qquad\qquad\qquad\quad 分子量134 \qquad\qquad\quad\qquad\qquad 分子量111

\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 

\quad\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*6(N?[b]-(=O)-N=(-NH_2)-=?[b]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\quad\qquad リン酸 \qquad\quad ＋\qquad\qquad シトシンヌクレオ\underline{\textbf{シ}}ド

\qquad\  分子量98\qquad\qquad\qquad 分子量$134+111-18=227$


\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 


\qquad\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*6(N?[b]-(=O)-N=(-NH_2)-=?[b]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]O-[4]P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\qquad\qquad\qquad\qquad\qquad シトシンヌクレオ\underline{\textbf{チ}}ド

\quad\qquad\qquad\qquad\qquad  分子量$98+227-18=307$

\newpage

\section*{デオキシリボグアノシン１リン酸（dGMP）の生成}

dGMP：deoxylibo Guanosine Mono Phosphate。DNAを形作るモノマーの１つ。

RNAで対応するモノマーはGMP。

\underline{dGMPとGMPを合わせてグアニンヌクレオチド}と呼ぶ。

\ 

\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
OH)(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}
\chemfig{*5(N?[a](-H)-(*6(-N=(-NH_2)-NH-?[b](=O)))=?[b]-N=?[a])}

\vskip0.5zw

\qquad リン酸 \qquad ＋\qquad\quad デオキシリボース\qquad ＋\qquad 塩基（例としてグアニン）

\quad\  分子量98\qquad\qquad\qquad\quad 分子量134 \qquad\qquad\quad\qquad\qquad 分子量151

\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 

\quad\chemfig{
HO-P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-OH
}
\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*5(N?[c]-(*6(-N=(-NH_2)-NH-?[b](=O)))=?[b]-N=?[c]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\quad\qquad リン酸 \qquad\quad ＋\qquad\qquad グアニンヌクレオ\underline{\textbf{シ}}ド

\qquad\  分子量98\qquad\qquad\qquad 分子量$134+151-18=267$


\ 

\hskip17zw$\downarrow$

\ 


\qquad\chemfig{
^1?[a]C(-[:60,1.2,2] %塩基のほう
*5(N?[c]-(*6(-N=(-NH_2)-NH-?[b](=O)))=?[b]-N=?[c]))(-[:-60,,2]H) % 1位炭素
<[:-130,1.8,2,2] % 1-2結合
^2C(-[2,,2]H)(-[6,,2]H) % 2位炭素
-[:180,1.5,,2,line width=3pt] % 2-3結合
^3C(-[2,,2]H)(-[6,,2]OH) % 3位炭素
>[:130,1.8] % 3-4結合
^4C(-[:120,1.2,2,2]^5CH_2-[4]O-[4]P(-[2]OH)(-[6,,,,->]O)-[4]HO)%リン酸のあたり
(-[:-120,,2]H) % 4位炭素
-[:20,2.25]O?[a] % 4-O
}

\vskip0.5zw

\qquad\qquad\qquad\qquad\qquad グアニンヌクレオ\underline{\textbf{チ}}ド

\quad\qquad\qquad\qquad\qquad  分子量$98+267-18=347$



%\chemfig{
%C?[a](-[:60,1.2] %塩基のほう
%*5([:0]-NH-*6(-N=-N=(-[2]NH_2)-=)--N=)
%)(-[:-60]H) % 1位炭素
%<[:-130,1.8] % 1-2結合
%C(-[2] H)(-[6]H) % 2位炭素
%-[:180,1.5,,,line width=3pt] % 2-3結合
%C(-[2]H)(-[6]OH) % 3位炭素
%>[:130,1.8] % 3-4結合
%C(-[:120,1.2,1,1]CH_2-[4]HO)%リン酸のあたり
%(-[:-120]H) % 4位炭素
%-[:20,2.1]O?[a] % 4-O
%}
%
%\ 
%
%
%\chemfig{
%C?[a](-[0,1.2] %塩基のほう
%*5(-N-*6(-N=-N=(-[2]NH_2)-=)--N=)
%)(-[6]H) % 1位炭素
%<[:-130,1.8] % 1-2結合
%C(-[2] H)(-[6]OH) % 2位炭素
%-[:180,1.5,,,line width=3pt] % 2-3結合
%C(-[2]H)(-[6]OH) % 3位炭素
%>[:130,1.8] % 3-4結合
%C(-[2,1.2,1,1]CH_2-[4]O-[4]P(=[6]O)(-[2]OH)-[4]O-[4]P(=[6]O)(-[2]OH)-[4]O-[4]P(=[6]O)(-[2]OH)-[4,1.2]HO)%リン酸のあたり
%(-[6]H) % 4位炭素
%-[:20,2.1]O?[a] % 4-O
%}

\end{document}