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せつめい

chemfig/cfigサンプル.tex化学・構造式 chemfighybrid

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\documentclass[b4j,landscape,twocolumn,10pt,twoside,noaux]{tetsujsarticle}
\usepackage{tetsuchem}
\makeatletter

\begin{document}

\小見出し{せつめい}

異なる結合長が必要な場合には，

\cfig{CH3 -[,1.4] OH}

\noindent のように打つ必要があります。これは1.4倍に伸ばすという意味です。

一般に，結合の後には [ ] オプションで，最大4つのオプション引数を指定できます。

\verb/\cfig{CH3 -[:90,1.5,2,1] OH}/

のように指定します。

\begin{箇条書き}
\item 第1引数の :90 は，90度方向に結合を伸ばすという意味です。負の角度も含めて任意の角度が指定できます。
\item 第1引数を : なしで書くと，45度の倍数での指定を意味します。例えば，CH3 -[3] OH と指定すれば，135度方向に -OH という結合が伸びます。ただし0〜7の整数のみが認められ，負の値は指定できません。
\item 第2引数の 1.5 は，結合の長さを1.5倍に引き伸ばすことを意味します。
\item 第3,4引数の 2,1 の部分は，左の原子団(CH3)の2つ目の原子(H)と，右の原子団(OH)の1つ目の原子(O)を結ぶ結合を作ることを意味します。これらのオプションは，特に斜めや上下方向に結合を伸ばすときに役立ちます。
\item 後ろの方の不要なオプション引数は略せます。例えば角度のみが必要な場合は -[:60] のような指定で，角度と長さが必要な場合は -[:-90,1.5] のように指定できます。
\item 長さのみが必要な場合は，第1引数をスキップするために空のコンマを打ちます。 -[,1.5] のようにします。
\item 2つの原子の後に ? を打っておくと，その2つの原子が結合されます。環構造を作るときに使います。例えばシクロブタンは

\br{.5}

\cfig{C?H2 -[,1.4] CH2 -[2,1.4] CH2 -[4,1.4] C?H2}

\noindent のように書けます。（結合の長さは全部1.4倍に引き伸ばしています。）
\end{箇条書き}



\小見出し{一行で書ける構造式の比較}

\ce{H - O - O - CH2 - CH2 - CH=CH - CH2 - C#C - CH3}

\cfig{H - O - O - CH2 - CH2 - CH=CH - CH2 - C~C - CH3}

\ce{CH3 - CO - CH2 - NO2}

\cfig{CH3 - CO - CH2 - NO2}

\ce{3CH3CH2CH2 - CO - CH2 - NO2}

\cfig{3CH3CH2CH2 - CO - CH2 - NO2}

\ce{CH2=CH-CH2-CH=CH2}

\cfig{CH2=CH-CH2-CH=CH2}

\br1

\小見出し{枝分かれのある構造式}

\br{.5}

\cfig{H-C(=[:90]O)-O-CH(-[2]CH3)- CH2 -CH3}

\br{.5}

\cfig{CH3 - C(=[:90]O)-O-CH(-[2]CH3)- CH2-CH3}

\br{.5}

\cfig{CH3 - CH(-[2]CH3) - CH2 - OH}

\br{.5}

\cfig{CH3 - C([:90]-CH3)([:-90]-OH) - CH3 }

\br{.5}

\cfig{CH3-C(=[:90]O)-H}

\br{.5}

\cfig{CH3 - CH(-[:-90]OH) -CH2 - CH3}

\br{.5}

\cfig{CH3 - C([:90]-CH3)([:-90]-OH) - CH3 }

\br{.5}

\cfig{CH3 - CH ([:90]-CH3)-CH2-OH}

\br{.5}

\cfig{CH3 - C([:-90]=O)- CH3}

\br{.5}

\cfig{H - C([:90]=O)- OH}

\br{.5}

\cfig{CH3-CH2-C(=[2]O)-ONa}

\br{.5}

\cfig{CH3  - CH(-[6]OH) -CH2 - CH3}

\br{.5}

\cfig{CH3 - CH(-[2]CH3) - CH2 - OH}


\br{.5}

\cfig{CH3 - C([:90]-CH3)([:-90]-OH) - CH3 }

\br{.5}

\cfig{H -[:-45,1.2] C(-[:-135,1.2]H)=C(-[:45,1.2]CH3)-[:-45,1.2] C(-[:-135,1.2]H)=C(-[:45,1.2]H) -[:-45,1.2] H}

\br1

\小見出し{不斉炭素原子の表示}

\br{.5}

\cfig{CH3 - CH2 - ^{*}CH(-[6,,2]OH) - CH3}

\br1

\小見出し{反応式}

\br{.5}
\cfig{CH3 - CH(-[:270]OH) - CH2 - CH3 +} \ce{(CH3CO)2O}\ce{->}\cfig{CH3-C(=[:90]O)-O-CH(-[2]CH3)- CH2-CH3} + \ce{CH3COOH}

\br{.5}

\[
 \underset{\text{アセチレン}}{\支柱*[0pt][13pt]{\ce{HC\tbond CH}}}
 \ce{->C[H2O][(HgSO4)]}\underset{\text{ビニルアルコール}}{\left[\niju{H}{H}{H}{OH}\right]}
 \ce{->C[~~~~~~~~~]} \underset{\text{アセトアルデヒド}}{\支柱*[0pt][15pt]{\cfig{CH3-C(=[:90]O)-H}}}
\]

\br{.5}

\[\underset{\text{ホルムアルデヒド}}{\支柱*[5pt][5pt]{\cfig{H - C([:90]=O)- H}}}
\ce{->C[~~酸化~~]}
\underset{\text{ギ酸}}{\支柱*[5pt][5pt]{\cfig{H - C([:90]=O)- OH}}}
\ce{->C[~~酸化~~]}
\underset{\text{炭酸}}{\支柱*[5pt][5pt]{\cfig{HO - C([:90]=O)- OH}}}
\ce{->C[~~分解~~]}
\ce{CO2 + H2O}
\]




\br1

\小見出し{エステル化}

\br{.5}

\cfig{H - C(=[2]O) -}\点線枠囲み[線分長=1pt,間隔=1pt,fboxsep=2pt]{\cfig{OH + H}}\cfig{O - CH (-[2]CH3) - CH2 - CH3} \ce{->}  \cfig{H-C(=[:90]O)-O-CH(-[2]CH3)- CH2 -CH3 + H2O} 

\br1

\小見出し{環状化合物}

\br{.5}

\cfig{O=[:-90]C?-[:-150]C(-[:150]H)=[:-90]C(-[:-150]H)-[:-30]C(=[:-90]O)-[:50,1.3]O?}


\br1

\小見出し{ベンゼンの側鎖}

\br{.5}

\ophenyl{\cfig{C(=[:90]O) - O - CH3}}{\cfig{O - C(=[:-90]O) - CH3}}

\br1

\小見出し{\ce{(CH2)4}など}

\br{.5}

\cfig{CH3 - {(}CH2{)}4 -[,1.2] CH (-[2]CH3) - CH3}

\newpage

\小見出し{芳香族化合物}

\br{.5}

使い方：\verb.\bfig{*6(=-=-=-)}. でベンゼンが書けます。

\br{.5}

\bfig{*6(=-=-=-)}

\br{1}

それに枝を付けることでどんどん伸ばしてゆけます。

\br{.5}

\bfig{*6(=-=(-CHO)-=-)}

\br{.5}

\bfig{*6(=-=-(-CHO)=-)}

\br{1}


\verb/\bfig/ を使った場合は添字の上げ下げは自動ではなされないので，\verb/CH_3/ のように書く必要があります。

\br{.5}

\bfig{*6(=-(-CH_3)=(-CH_3)-=-)}

\bfig{*6(=-(*6(-=-=-))=-=-)}

\bfig{*6(=-=(*6(-=-=-))-=-)}

\bfig{*6(=-=-(*6(-=-=-))=-)}

\bfig{*6(=-(*6(-=(*6(-=-=-))-=-))=-=-)}

\bfig{*6(=-(*6(-=-(*6(-=-=-))=-))=-=-)}


\bfig{[:30]*6(=-(-N=N-*6(-*6(-=-=-)=-=-(-HO)=))=-=-)}

\br{1}

*6 の部分を **6 にすれば中が円のベンゼン環になります。

\br{.5}

\bfig{[:30]**6(--(-N=N-**6(-**6(-----)----(-HO)-))----)}


\br{1}

?を2箇所に付けることで環をつなげます。

\br{.5}

\bfig{*6(=-(-C?(=[:-90]O))=(-C(=[2]O)-[:-30,1.2]O?)-=-)}

\br1

環状構造を2つ以上作りたい場合は，?[a] と ?[b] のように，?にラベルを付けて，どことどこを結びたいのかを明示します。

\br{.5}

\cfig{C?[a]H2 -[,1.1] C?[b]H -[,1] CH2 -[:270,1.3] CH2 -[:180,1.05] C?[b]H-[:180,1.05] C?[a]H2}

\br{1}

次の例はカフェインです。

\br{.5}

{\setcfigbondlength{13pt}
\cfig{N?[a](-[:150]CH3) -[6] C(=[:-150]O) -[:-30] N(-[6]CH3) -[:30] C (-[:-18] N =[:54] C -[:126] N?[b](-[:72] CH3) )=[2]C?[b]-[:150]C?[a](=[2]O)}}




\br1

\小見出し{高分子}

\小小見出し{ポリビニルアルコール}
\br{.5}

\cfig{{\hamidasi(3pt,-5pt)[L]{$\Biggl[$}} -[,1.4] CH2 - CH(-[6]OCOCH3) -[,4.8] {\raisebox{-5pt}{\makebox[0zw][r]{$\Biggr]_n$\hspace{-2pt}}}}}

\br{.5}

\cfig{{\hamidasi(3pt,0pt)[L]{$\Bigggl[$}} -[,1.4] C(-[2]H)(-[6]H) - C(-[2]H)(-[6]OCOCH3) -[,5.5] {\makebox[0zw][r]{$\Bigggr]_n$\hspace{-5pt}}}}

\br1

\小小見出し{ポリイソプレン}

\br{.5}

\cfig{{\hamidasi(2pt,16pt)[L]{$\biggggl[$}} -[,1.4] CH2 -[:45,1.4] C (-[:135,1.4,,2] CH3\ \ {}) =  C(-[:45,1.4]H) -[:-45,1.4] CH2 -[,1.2] {\makebox[0zw][r]{\hamidasi(0pt,16pt)[L]{$\biggggr]_n$}\hspace{10pt}}}}


\br1

\小小見出し{クロロプレン}

\br{.5}

\cfig{H -[:-45,1.2] C (-[:-135,1.2] H) = C (-[:45,1.2] Cl) -[:-45,1.2] C(-[:-135,1.2] H) = C (-[:45,1.2] H) -[:-45,1.2] H}

\br1


\小見出し{イオン}

\小小見出し{オキソニウムイオン}

\br{.5}

\cfig{H -[,1.14] O {\hamidasi(0zw,0zw)[L]{${}^+$}} (-[6,1.14]H) -[,.75,,,dotted,line width=0pt,dash pattern=on 0pt off 20pt,color=white]  -[,.75]H}

\br1

\小小見出し{ケイ酸イオン}

\br{.5}

\cfig{ $\makebox[0pt]{\vphantom{O}}$^{-} O - Si (-[2] O {\hamidasi(0pt,0.8pt)[L]{\ce{{$\vphantom{O}$}^-}}} {}) (-[6] O {\hamidasi(0pt,0.8pt)[L]{\ce{{$\text{\fsize{0.1pt}\textcolor{white}{i}}$}^-}}} {}) -[,1.24] O^{-}}


\br1

\小見出し{配位結合}

\br{.5}

\cfig{H - N(-[:90,,,,stealth-]H)(-[:-90,,,,->]H) -[,1.4,,,-latex] H}



\br1

\小見出し{くさび}

\br{.5}

{\setcrambond{2.3pt}{.8pt}{1pt}
\cfig{C(-[2,1.4,,,,,dash pattern=on 9pt off 10pt]H)(-[:-145,1.4]H)(<:[:-10,1.4]H)(<[:-60,1.4] {\thamidasi(1pt,-1pt){H}})}
}


\br1

\小見出し{水素結合}

\br{.5}

\cfig{R-C(=[1]O)(-[7]O-H)}\quad+\quad\cfig{C(=[5]O)(-[3]O-[4]H)-R}\quad\ce{<=>C[~会合~][~解離~]}\quad\cfig{R-C(-[7]O?)(=[1]O-[,2,,,,,,dash pattern=on2pt off2pt]H-O-[7]C(-R)=[5]O-[4,2,,,,,,dash pattern=on2pt off2pt]H?)}

\br{.5}

\newpage

\小見出し{その他}


{
\nousece
\setatomsep{3em}
\setbondoffset{2pt}
\setcrambond{2pt}{}{}
\chemfig{
  HO-[2,.5,2]?<[7,.7](-[2,.5]OH)-[,,,,line width=2.4pt](-[6,.5]OH)>[1,.7]
    (-[:-65,.7]O-[:65,.7]?[b](-[2,.7]CH_2OH)<[:-60,.707](-[6,.5]OH)
      -[,,,,line width=2.4pt](-[2,.5,,2]HO)>[:60,.707](-[6,.5]CH_2OH)-[:162,.9]O?[b])
  -[3,.7]O-[4]?(-[2,.3]-[3,.5]HO)
}
\hspace{4zw}
\setatomsep{2em}
\chemfig{
  H_3C-[:72]N
    *5(-*6(-(=O)-N(-CH_3)-(=O)-N(-CH_3)-=)--N=-)
}
}

\br1

\小見出し{縦方向の位置揃え}

\verb|\cfig| を普通に使うと，\gt{開始原子の位置に縦位置が揃います}。

\begin{align*}
\cfig{C(-[3]H)(-[1]C(=[2]O)-[0]OH)=[6]C(-[5]H)(-[7]C(=[6]O)-[0]OH)}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - CH(-[6]OH) - CH3} 
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\cfig{C(-[3]H)(-[1]C(=[2]O)-[0]O - CH(-[2]CH3) - CH3)=[6]C(-[5]H)(-[7]C(=[6]O)-[0]OH)}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\ce{H2O}
\end{align*}

\verb|\parboxx{...}| で囲んでおくことにより，構造式を縦方向中央揃えにすることができます。

\begin{align*}
\parboxx{\cfig{C(-[3]H)(-[1]C(=[2]O)-[0]OH)=[6]C(-[5]H)(-[7]C(=[6]O)-[0]OH)}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - CH(-[6]OH) - CH3} 
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\parboxx{\cfig{C(-[3]H)(-[1]C(=[2]O)-[0]O - CH(-[2]CH3) - CH3)=[6]C(-[5]H)(-[7]C(=[6]O)-[0]OH)}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\ce{H2O}
\end{align*}

ただし，次のような場合は調整がちょっと面倒です。
\begin{align*}
\bfig{*6(=-(-OH)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)} 
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - C(=[1]O) -[7]O -[5]C(=[7]O) -[4] CH3}
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\bfig{*6(=-(-O -[0] C(=[6]O) -[0] CH_3)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)} 
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - C(=[2]O) - OH}
\end{align*}

これを，単純に \verb|\parboxx{...}| で囲んで縦方向中央揃えにすると，サリチル酸の構造式が，人間が思ういい感じの縦位置になりません。
\begin{align*}
\parboxx{\bfig{*6(=-(-OH)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\parboxx{\cfig{CH3 - C(=[1]O) -[7]O -[5]C(=[7]O) -[4] CH3}}
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\parboxx{\bfig{*6(=-(-O -[0] C(=[6]O) -[0] CH_3)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - C(=[2]O) - OH}
\end{align*}

このような場合は，\verb|\raisebox| による縦位置手動修正が必要です。
\begin{align*}
\raisebox{9pt}{\parboxx{\bfig{*6(=-(-OH)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)}}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\parboxx{\cfig{CH3 - C(=[1]O) -[7]O -[5]C(=[7]O) -[4] CH3}}
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\parboxx{\bfig{*6(=-(-O -[0] C(=[6]O) -[0] CH_3)=(-C(=[2]O)-[0]OH)-=-)}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - C(=[2]O) - OH}
\end{align*}

なお，\verb|\ophenyl| を使えば初めからいい感じになります（詳細は \mtt{構造式描画命令サンプル.tex} 参照）。
\begin{align*}
\ophenyl{\cfig{C(=[2]O)-OH}}{OH}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\parboxx{\cfig{CH3 - C(=[1]O) -[7]O -[5]C(=[7]O) -[4] CH3}}
  \ihspace{2zw}\ce{-> }\ihspace{2zw}
\ophenyl{\cfig{C(=[2]O)-OH}}{\cfig{O - C(=[6]O) - CH3}}
  \ihspace{1zw} + \ihspace{1zw}
\cfig{CH3 - C(=[2]O) - OH}
\end{align*}


\end{document}